Музей лицея №6 им. Героя Советского Союза И. З. Шуклина в г. Горно-Алтайске был открыт в 1988 году на базе комнаты И. З. Шуклина. Музей расположен в двух смежных комнатах площадью 90 кв. метров.
В 50-е годы учителя и учащиеся школы своим упорным трудом, отличной учебой и художественным творчеством заслужили права присвоения школе имени выпускника, Героя Советского Союза И.З.Шуклина, а воинская часть города Бийска вручила средней школе №6, носящей имя Героя боевое Красное знамя, которое как реликвия хранится в музее школы.
Директором школы в эти годы был Павел Лукич Казанцев- человек, прошедший войну. В школе была создана Комната, посвященная памяти Героя.
В 70-е годы под руководством директора школы Нины Прокопьевны Федоровой началась работа по реконструкции и обновлению экспозиции Комнаты Боевой Славы. Именно в то время была написана картина, отражающая фрагмент боя артиллериста Ильи Захаровича Шуклина, которая является частью военной экспозиции музея.
В комнате Боевой Славы собирали и бережно хранили фотографии, воспоминания родных и одноклассников Ильи, школьные реликвии и награды, знамена, пионерскую атрибутику. Здесь проводились все торжественные собрания, открытые уроки, здесь же устраивали встречи с фронтовиками. Ученики школы с честью продолжали нести традиции своих предшественников.
1988 год. 50-летний юбилей школы. Комнату Боевой Славы преобразовали в музей. Активисты военно-исторического музея знакомили учеников с материалами поисковой работы. Школьники с удовольствием участвовали в работе музея и группы «Поиск». Частыми гостями ребят были ветераны войны. Долгие годы возглавляла эту работу старейший учитель школы Коротовская Татьяна Васильевна.
2008 год. 70-летний юбилей школы. В процессе реконструкции музея произошли изменения в экспозиции, добавлен новый материал, касающийся истории школы, ее учителей и выпускников. Наглядно воссоздана Летопись школы. Значительно увеличился объем информации. Возглавила эту работу учитель истории, руководитель школьного музея Крылова Светлана Пантелеевна.
2018 год. 80-летний юбилей школы. Музей является центром военно-патриотического воспитания молодежи. Активисты музея сохраняют реликвии и награды, пять знамён, пионерскую атрибутику. Краеведы участвуют во многих мероприятиях лицея, регулярно организуют и проводят встречи с участниками Великой Отечественной войны, труженниками тыла.
2023 год. 85-летний юбилей школы. В настоящее время интерес к музею учеников школы, ее выпускников, учителей не угасает. В нем проводятся обзорные и тематические экскурсии, городские мероприятия, конференции, встречи с ветеранами.
Достижения музея на муниципальном, региональном и/или федеральном уровнях:
2009 г. музею присвоена высшая квалификационная категория
2010 год –III место в заочном Республиканском смотре-конкурсе школьных музеев.
III место в региональном этапе Всероссийского проекта «Наша общая Победа».
2012 год - I место в Республиканском заочном смотре-конкурсе музеев образовательных учреждений Республики Алтай.
2015 год - Победитель городского смотра-конкурса «Лучший музей общеобразовательного учреждения».
2017 год - Музей Лицея занимает первое место в городском смотре конкурсе школьных музеев.
2018 год – Диплом II степени регионального этапа Всероссийского конкурса «Лучший школьный краеведческий музей - 2018 »в рамках федерального партийного проекта Единой России «Историческая память».
2020 год - сертификат, подтверждающий, что военно – исторический музей Лицея является Партнером «Центрального музея Великой Отечественной войны 1941-1945гг.» или Музея Победы.
2023 год – диплом I место в Республиканском заочном смотре-конкурсе музеев образовательных учреждений Республики Алтай.
Музей Лицея включен в реестр школьных музеев